Friday, March 19, 2010

Secuencian геном Naegleria

Последовательность генома Naegleria помогает понимать, каким был первый eucariota, чтобы ограничивать минимальный геном и чтобы анализировать метаболические экзотические пути, которые кроме того, может быть, могли бы служить источниками энергии.

naegleriaNaegleria в бичевавшей фазе. Источник: Lillian Fritz-Laylin, UC Berkeley.

Научная важность открытия или его важность mediática иногда они не совпадают. Открытие новой окаменелости динозавра, с или без ручек, обычно имеет некое попадание mediático. Но динозавры, такие кинематографические они, не наши биологические предки, у них не была бы должна бы быть такая важность, хотя они возбудят наше воображение. Даже фауна Бургесс Сале, с его странными существами, они обычно не имеют значение много, хотя она будет рассказана великолепной прозой Стивен Х. Gould. Поэтому, если мы восходим еще более назад во времени, и мы говорим о микроорганизмах, нормально, чтобы люди с небольшим количеством тревог перешли из темы в вопросе.
Но микроорганизмы - короли создания. Они были единственными жителями этой планеты в течение тысяч миллионов лет и, еще теперь, жизнь в Земле была бы невозможной без них. Именно приблизительно добавки изощренных микроорганизмов. В каждой клетке нашего тела все еще живут в endosimbiosis mitocondrias, дегенеративные бактерии, которые предоставляют нам энергию. Даже игнорируя он был сделан, Вы, читающий друг, он имеет в его теле 10 бактерий каждой соматической клеткой.
История жизни - длинная история, с единственными событиями, фундаментальные события, которые изменили ее навсегда. Один из этих переходов был шагом клеток procariotas без ядра, как бактерии и ты тошнишь, в клетки eucariotas содержащие ядро. Считается, что это событие произошло 1500 миллионов лет назад. Почти у нас нет ископаемых останков той эпохи, так что мы должны изловчаться она, чтобы проверять, что он произошел. Один из способов состоит в том, чтобы смотреть в геноме различных видов. В этих генетических книгах рассказана часть этой истории, если мы делаем упражнение “сравнительной литературы”. Это одна из причин, из-за которых последовательности организмы: чтобы знать больше о прошлом.
Один из генома недавно secuenciado - геном Naegleria gruberi. Это существо достаточно свойственное с биологической точки зрения и его геном может помогать нам понимать переход procariotas в eucariotas.
Работу принесли в термин ученые Department of Энерги Хоинт Хеноме Институте (JGI) Университета Berkeley и эксперты Университета Lancaster по Объединенному Королевству.
Naegleria - общая амеба почвы, которая посвящает себя охоте на бактерии. Образцы secuenciados изолировались, в этом случае, грязи рощи эвкалиптов в кампусе Университета Berkeley. Когда этот организм находится под стрессом, он растут бичи, которые orgánulos сходные с бичом сперматозоидов, и он начинает плавать в поисках лучших территорий. Кроме того, у него есть третье тождество; если условия почвы становятся очень твердыми, тогда он преобразовывается в твердую кисту и ждет лучшие времена.
Согласно Симон Э. Prochnik, такой процесс как этот преобразовывания в бичевавшего начиная с состояния ameboideo - очень редкий.

ФотографияОн микрофотографирует из-за электронной микроскопии подметания (левой стороны) фазы кисты Naegleria. В прямую фазу ameboidea того же микроорганизма. Источник: Lillian Fritz-Laylin, UC Berkeley.

Prochnik и его сотрудники открыли, что у этого организма есть, логически, свертки генов, посвященные всем этим "личностям". Его геном содержит ни больше, ни меньше, чем 15.727 шифрующих гена протеинов, которые это число, сравнимое с 23.000 в людях.
Разум, которым Naegleria имеет столько генов, проистекает из его сложного стиля жизни. У большинства организмов unicelulares есть мало генов. Согласно Prochnik, в существо такой переменчивый организм, его геном должен содержать необходимую информацию, чтобы выживать в разнообразии атмосфер, в которых он это делает, и под различными спектрами стресса, которые он подчинен.
Эти исследователи сравнили геном Naegleria с геномом 16 eucariotas, что шли грибов к людям проходя по растениям и простейшим. Свободный организм не паразит, который не потерял часть его генов и функций, позволил более широкое сравнение существу и позволяет находить больше протеинов, которые были в древних eucariotas. Они идентифицировали набор 4000 генов, который, согласно этим ученым, вероятно был бы частью самого примитивного генома eucariota.
Расположенное напротив число генов застало исследователей, потому что в предварительных сравнениях, которые включали в микроорганизмы паразитов, он подошел близко в нижнее число, вероятно благодаря тому, что паразиты уполномочивают часть его функций на гены существа, которое приютит их. Этот результат может помогать определять, следовательно, минимальное число генов, которые позволяли бы независимую жизнь.
Это первая сравнительная генетика, которая включает не только Naegleria, а кроме того в представителей шести групп eucariotas secuenciados, как chromalveolata, diatomeas, причиняющий микроорганизм малярии, микробов красного прилива и отлива, амеб или паразитов как giardia.
Между другими интересными результатами этого изучения он находится, что он может помогать бросать свет как двигаются клетки, как посылают знаки одни другим или как они метаболизируют питательные вещества.
Naegleria использует pseudópodos в его фазе ameboidea в его перемещениях, чтобы охотиться на бактерии, но когда еда исчезает, развивает бичи с “она ничто” и использует их, чтобы плавать в лучшие территории охоты. Но pseudópodos и бичи используют различные протеины для движения. Первый, основанный в actina, что создает строительные леса внутри клетки. Второй основан на tubulina. Как у этого организма есть обе системы он может помогать ученым понимать происхождение этой параллельной системы в течение эволюции eucariotas.
Когда ученые подчинили население Naegleria недостатку питания, они подтвердили, что почти все менялись быстро в его бичевавшую форму, которым изменение системы, основанной в actina в другом microtúbulos высоко регулярное и синхронизировавшее во всем населении.
Геном этого микроорганизма также раскрывает, как производит энергия. Он может использовать кислород, чтобы "сжигать" такие питательные вещества как глюкоза или жирные кислоты, или, если нет кислорода, использовать другие питательные вещества и метаболические пути, производя такой водород как побочный продукт. Вышеупомянутый механизм позволяет ему выживать hipoxia в грязной атмосфере, где он живет. Какой-либо из этих экспертов инспектирует, что это, может быть, смогло служить для того, чтобы произвести биотопливо, если могут понять хорошо вышеупомянутый метаболический путь.
Последовательность генома Naegleria - еще один шаг. Сравнительная между собой большего количества генома эволюционного дерева eucariotas поможет нам понимать эволюцию самых сложных животных и начинать понимать, откуда приходим мы. Потому что основная наука только стремится к тому, чтобы ответить на основные всегдашние вопросы: откуда мы приходим?: что мы?: adónde мы идем? … Эти ученые помогли доводить до сведения более, как это был tataratatara … taratabuelo microbiano Вас, читающий возлюбленный.

Copyleft: присуждать с соединением в http://neofronteras.com/?p=3031

Источники и ссылки:
Пресс-релиз UC Berkeley с видео.
Статья в Cell (резюме).

No comments:

Post a Comment